管理办法规定，重点排放单位（即纳入企业）名单由省级碳交易主管部门提出并上报，省级碳交易主管部门依据国家标准提出本行政区域内重点排放单位的免费分配配额数量，同时各省、自治区、直辖市结合本地实际，可制定并执行比全国统一的配额免费分配方法和标准更加严格的分配方法和标准。
由于国内各省经济发展水平不均，节能减排潜力和难度差异较大，这样的分配方式有利于地方根据实际情况合理制定分配方法，优化地区内配额分配，促进实现减排目标。 禸嫆@唻洎：狆國湠棑倣茭昜蛧 τāńｐāīｆāńɡ.ｃōｍ
同时，管理办法还规定各地方配额总量发放后剩余部分，可由省级碳交易主管部门用于有偿分配。有偿分配所取得的收益，用于促进地方减碳以及相关的能力建设。
这一设置有利于鼓励地区积极建设碳市场，提高减排目标。
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“通过给予地方一定灵活性，在国家目标实现的前提下，地方如果能更进一步进行减排，是值得鼓励的，”段茂盛说，“同时地方也更了解本地企业的实际情况，从各行业情况考虑也不会一味扩大拍卖规模，对企业来说，还是应该看作节能减排、进行技术改造的机遇。” 内-容-来-自；中_国_碳_0排放￥交-易=网 t an pa i fa ng . c om
根据管理办法，配额分配在初期将以免费分配为主，适时引入有偿分配，并逐步提高有偿分配的比例。国家发改委将根据不同行业的具体情况，参考相关行业主管部门的意见，确定统一的配额免费分配方法和标准。 夲呅內傛莱源亍：ф啯碳*排*放^鲛*易-網 τā ńｐāīｆāńɡ.ｃōｍ
不过，在企业最为关注的纳入范围上，管理方法尚未进行明确，仅表示将适时公布碳排放权交易纳入的温室气体种类、行业范围和重点排放单位确定标准。
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据21世纪经济报道记者了解，将来全国碳市场的初期纳入范围很有可能是“抓大放小”，主要为高耗能高排放行业，目前部分试点纳入的一些服务型行业则可能不会包括。
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在这一问题上，管理办法同样给了各试点一定的自主权，规定省级碳交易主管部门可适当扩大碳排放权交易的行业覆盖范围，增加纳入碳排放权交易的重点排放单位。
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这一规定满足了现在正在进行的七个碳交易试点的政策延续性需要。意味着对于目前各试点纳入企业而言，即使最终不在国家首批划入的控制排放企业范围内，也很有可能在按照试点所划范围继续被纳入碳交易系统，因此应及早做好相应准备。
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